Dados do Trabalho

Título

IDENTIFICACION DE GENES CANDIDATOS EN RESPUESTA DE TOLERANCIA A COBRE EN IMPERATA CYLINDRICA

Resumo

La metalófita Imperata cylindrica habita naturalmente suelos contaminados principalmente con cobre (Cu) de la zona central de Chile. En este estudio, I. cylindrica fue expuesta a 300 mg Cu kg-1 de suelo en condiciones de invernadero. Luego de 21 días de tratamiento se cosecharon las plantas con el fin de identificar los genes candidatos envueltos en la respuesta a estrés por Cu. El análisis transcriptómico fue realizado en hojas y raíz de plantas que crecieron con y sin suplementación con Cu. La secuenciación del ARN y el ensamblaje del transcriptoma de novo fue realizado para identificar los genes asociados a la respuesta de los mecanismos moleculares de tolerancia a Cu. El transcriptoma de novo constó de 200,521 transcritos, incluyendo ~91% de genes ultraconservados completos de la base de datos de eucariotas y plantas de la plataforma BUSCO. Los genes diferencialmente expresados (GDEs) en raíces fueron 7386, siendo 3558 de ellos más abundantes en la condición de estrés por Cu. La respuesta genética en hojas fue significativamente menor, siendo sólo 33 GDEs. Cabe destacar que en raíz encontramos GDEs asociados principalmente a la conformación de la actina y el citoesqueleto, pero también otros asociados al transportador de metales y a la actividad de la superóxido dismutasa. Estos resultados sugieren que el citoesqueleto podría ser el principal mecanismo responsable de la unión del Cu en la raíz, dando lugar a una respuesta eficiente de tolerancia al Cu en esta metalófita. Nuestro estudio contribuye en la búsqueda de especies vegetales que demuestran potencial de ser usadas como agente de biorremediación de suelos contaminados con Cu. 

Palavras-chave

Metalófita; Cu toxicidad; Cu tolerancia; ARN-Seq; Transcriptoma de novo

Instituição financiadora

Agencia Nacional de Desarrollo (ANID) de Chile, a través de los proyectos ANID/FONDECYT/1170264, ANID/FONDAP/15130015, ANID/PIA-ANILLO/ACM170002, ANID/Beca de doctorado/ 21150788 Y ANID/FONDECYT/3230116